El centro también esta estudiando la mineralización y el ciclaje de nutrientes en las plantaciones de cacao. Descubrieron que las plantaciones de cacao son muy eficientes en ciclar los nutrientes a través de la descomposición y asimilación de las hojas caídas. Como los agricultores tienen poca necesidad de aplicar abonos quimicos, fácilmente se puede certificar una plantación de cacao como finca orgánica, lo cual tiene varios beneficios en los mercados internacionales.

Las flores del cacao se polinizan por un mosquito que vive dentro del bosque. Como los agricultores no quieren dañar al mosquito, no aplican pesticidas en sus plantaciones. Por lo tanto, los agricultores tienen que buscar otras formas de combatir los pestes y patógenos del cacao. Así, la certificación orgánica es una opción bastante viable para los cacaocultores.